凝膠成像系統主要是為了適應研究者的技術標準和預算而設計。根據不同系統和相機配置，凝膠成像系統可提供多種用途。一般實驗室需要用到的140萬像素凝膠成像分析系統，主要針對拍攝普通的DNA或蛋白質凝膠的用戶，滿足基本的功能即可，在國產廠家中，可以生產出此類凝膠成像系統的廠家居多，但要做到足夠的性價比，就需要用戶貨比三家。
 

　　首先，是根據自己的需求選擇，凝膠成像分析系統原理可以分成兩大類，分別是拍照成像和掃描成像。拍照成像簡單說就是樣品和相機的相對位置不動，可以進行單次成像或多次成像;掃描成像則是相機對樣品進行局部成像，然后通過樣品或相機的移動對整個樣品進行成像。拍照成像目前主要采用CCD相機成像，由于可以設置不同的曝光時間，常被用來進行微弱的化學發光及生物發光的成像。而掃描成像則由于精度高、重復性好被廣泛用于大型樣品以及多通道成像中。可以說，對于大型樣品或多通道應用，能選擇掃描成像的，盡量不要選擇拍照成像。

　　其次，擇的品牌應該擁有自主生產分子影像成像分析系統的主要零部件的能力，特別是CCD的生產，濾光鏡片和多功能軟件這些主要部分，這樣可以為用戶以后維修零部件節省成本和為用戶提供質量的保證，同時這樣的廠家整套儀器的價位也可以有所降低;

　　第三，凝膠成像分析系統的品牌最好同時擁有分子影像成像系統和數字成像系統生產能力，或者有分子影像成像系統和數字成像系統相結合的產品，由于現在的數字成像系統已經在各個領域應用非常的廣泛，以后分子影像成像系統和數字成像系統相結合一定是一個新的趨勢。